38 espèces d'oiseaux marins et limicoles listées dans la directive européenne "Oiseaux" sont classées en enjeux majeur à faible dans la ZPS Mor Braz. Citons notamment :
Le Puffin des Baléares : cet oiseau rare en danger critique d’extinction vient passer l’été en nombre sur les côtes françaises, qui accueillent entre 32 et 40 % de l’effectif mondial. Le site Natura 2000 abrite entre 28 et 35 % de l’effectif national de l’espèce. Le Puffin des Baléares bénéficie d'un Plan National d'Actions de 5 ans renouvelables depuis 2021.
Le Plongeon imbrin est un hivernant rare et classé vulnérable en Europe. Bien que l’espèce soit probablement sous-détectée, l’effectif hivernant sur le site Natura 2000 est important, puisqu’il représente près de 9 % de l’effectif national.
La Macreuse noire : Près de 3 % des effectifs français hivernants de passent l’hiver dans la ZPS.